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CPHI原料藥展簡訊NGS在加強CML患者分子監(jiān)測中的應(yīng)用

ICON開發(fā)了新一代RNA測序(NGS)檢測方法,可以對慢性粒細胞白血病患者進行更準確的監(jiān)測。CPHI原料藥展了解到,這項基于RNA的新型定制NGS檢測(Dup-Seq BCR::ABL1),既可以鑒定BCR::ABL1轉(zhuǎn)錄本類型(常見和非典型),又可以檢測常見和非典型BCR::ABL1轉(zhuǎn)錄本類型的耐藥突變。

與CML領(lǐng)域中使用的標(biāo)準NGS檢測不同,CML領(lǐng)域使用的標(biāo)準NGS檢測需要至少3%的VAF,這種檢測方法通過重復(fù)PCR和糾錯檢測VAF低至1%的突變,實現(xiàn)了高靈敏度和高準確性。ICON的驗證研究顯示,這種新型檢測方法具有很高的準確度(融合PPA:98.5%;PPA 和 NPA 的突變率分別為 97.8% 和 100.0%)和靈敏度(來自 10,000 個 BCR::ABL1 輸入的突變檢測的 LoD 為 3%)。

此外,CPHI原料藥展獲悉,該檢測簡化了 CML 患者臨床管理中的分子檢測工作流程。在常規(guī)臨床檢查和臨床試驗中的應(yīng)用是多種多樣的。

對新 CML 患者的常規(guī)診斷檢查,該檢測的轉(zhuǎn)錄本分型結(jié)果可以指導(dǎo)選擇合適的 RT-qPCR 來監(jiān)測轉(zhuǎn)錄水平變化。而臨床試驗研究通常所需要的基線轉(zhuǎn)錄本類型鑒定,和突變檢測,這兩者都可以通過 Dup-Seq 來解決。

在這兩種治療反應(yīng)監(jiān)測期間,Dup-Seq可以跟蹤耐藥突變的產(chǎn)生和演變。

轉(zhuǎn)錄本類型鑒定可以作為一種質(zhì)量控制措施,簡言之,Dup-Seq簡化了常規(guī)臨床和臨床試驗環(huán)境中的分子檢測工作流程,將多種檢測(一種轉(zhuǎn)錄本類型鑒定檢測和幾種針對不同轉(zhuǎn)錄本類型的突變檢測)整合為單一的綜合檢測,來高效管理CML患者的治療數(shù)據(jù)。

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